脂肪肝病人可出现一项或多项肝功能试验异常。成人健康体检发现肝功能异常者中，约35%为脂肪肝。肝功能异常视肝内脂肪浸润的程度、范围和病因而定。ALT和AST(旧用SGOT)可以轻度至中度升高(一般不超过正常值的2～3倍)，非酒精性脂肪肝常出现AST/ALT比值小于I，而酒精性脂肝AST/ALT比值常大于2。GGT也可升高，酒精性脂肪肝时升高尤为明显，约30%严重脂肪肝病人可出现不同程度ALP升高。约一半以上脂肪肝病人出现染料(靛青绿)排泄试验异常。血清胆红素、白蛋白、PT通常无明显变化。慢性重症脂肪肝病人有时也可出现血浆蛋白总量改变和白蛋白/球蛋白比例倒置，PT延长，应用维生素K可以纠正。但经肝活检证实的脂肪肝，仅20%~30%的病人有上述一项或几项指标异常，因此实验室检查并不能确切反映脂肪肝的有无及其程度。