PSC易感性的相关基因主要为HLA-B8及HLA-DR3，它们是众所周知的致自身免疫疾病的基因，这提示PSC的发病机制是由自身免疫介导的肝内、外胆管损伤，其体液免疫与细胞免疫均呈异常。

一、体液免疫

（一）体液免疫异常

PSC病人血清中可检出自身免疫性抗体，但大多为非特异性，出现的频率亦较低，特异性抗体尚待进一步鉴定。体液免疫异常表现如下：

1.高γ-球蛋白血症  主要成分为IgM。

2.多种自身抗体  抗平滑肌抗体（ASM），抗核抗体（ANA），抗线粒体抗体（AMA），抗结肠抗体（anti-coionic），抗门脉抗体（anti-portal），抗内皮细胞抗体等，出现频率均低。

3.抗嗜中性粒细胞核周胞质抗体（perinuclear　antineutrophil　cytoplasmic；pANCA）阳性率高达80％。

4.补体系统激活  血清及胆汁中循环免疫复合物的水平升高；免疫复合物清除异常。

（二）血清标志抗体问题

PEC病人血清中的标志性抗体为AMA，在PSC病人是否存在类似的标志性抗体，一直是学者们热衷探讨的问题。在结肠及胆管上皮细胞表面，有特异性抗原表型的表达，2/3的PSC病人血清中可检出针对特异性表型的抗体。PSC病人无论伴有或不伴有CUC，约2/3病人血清中可检出pANCA，由于方法学的不同，有关pANCA的敏感性与特异性的报道也不一致，但有学者提出pANCA可作为PSC病人的血清标志性抗体。进一步研究提示：在PSC自然病程中，pANCA的滴度波动很大，缺乏诊断的特征性；pANCA的滴度与疾病的活动性、生化异常及肝组织学改变均无相关性；在肝移植后及直肠结肠切除术后，pANCA的滴度可持续异常；鉴于以上原因，直到目前pANCA仍未能作为筛选PSC的血清学标志。

关于PSC病人出现pANCA的意义，认为可出现更为广泛的胆道疾病，致于与pANCA相关的抗原，已报道的为组织蛋白酶（cathepsin）、糜蛋白酶样蛋白酶（chymotrypsin-likeprotease）以及杀菌性/通透性增加的蛋白（bactericidal/permeability increasing protein，一种多形粒细胞的内毒素结合蛋白），但PSC病人血清中pANCA的相关抗原决定簇仍有待进一步加以鉴定。

二、细胞免疫

（一）细胞免疫异常

1.循环中T细胞数量及功能改变  主要是CD8（抑制性/细胞毒性）不成比例减少，致使CD4/CD8比值增加及T细胞总数明显减少。

2.有肝硬化者较无肝硬化者循环中CD4/CD8比值增加更明显；

3.循环中B细胞的绝对数与百分数均升高；

4.外周血及汇管区γδT细胞的绝对值与百分数均升高；

5.T细胞受体Vβ3基因段显性等位基因表达，见于T淋巴细胞浸润的肝内病变区。

以上改变提示PSC病人的免疫调节紊乱。

（二）细胞免疫的靶抗原-胆管上皮细胞

1.PSC患者早期或肝外胆道阻塞后，胆管上皮细胞HLA-Ⅱ类抗原表达增加，提示其成为能对自身或外源性抗原的提呈细胞（APC），以激活宿主淋巴细胞的自身免疫活性。

2.细胞间黏附分子-1（ICAM-1）是淋巴细胞功能相关性抗原-1（LFA-1）黏附受体的配体，促进淋巴细胞与APC之间的紧密接触，在PSC病人肝硬化期时，胆管上皮细胞的ICAM-1表达增加，循环中的含量亦升高。

3.前炎性细胞因子（proinflammatory　cytokines）诱导胆管上皮细胞HLA-Ⅰ类及HLA-Ⅱ

类抗原的表达，它在PSC发病机制中所起的作用尚待阐明。